Hissène Habré né en 1942 est un homme politique tchadien. Il a été président du Tchad de 1982 à 1990.Il est originaire de l'ethnie Gorane ou Toubou. Il appartient au clan Anakaza.
Hissène Habré, chef des Forces Armées du Nord (FAN) renversa Goukouni le 7 Juin 1982 pour occuper le poste de président. Le poste de premier ministre fut supprimé et plusieurs opposants politiques furent exécutés. Habré transforma les FAN en armée régulière (FANT), puis créa une police politique, la Direction de la documentation et de la sécurité (DDS).
Le GUNT, le gouvernement de transition chassé du pouvoir par les forces d'Hissein Habré, se retire dans le Nord du Tchad. Il est aidé par la Libye qui annexe depuis 1973 la bande d'Aozou. La guerre s'aggrave en 1983 et les forces libyennes occupent le nord du Tchad jusqu’à la contre-offensive des forces d'Habré qui aboutit en mars 1987 à la reconquête du Nord avec le soutien de l’armée française. Durant le conflit, les États-Unis auraient utilisé une base clandestine au Tchad pour entraîner des soldats libyens capturés et les organiser en force anti-Kadhafi. Ils auraient également fourni un support militaire et organisationnel à la DDS.
L'aide de la France et des États-Unis a été décisive. L'occupation libyenne a pris fin en mars 1987. Un cessez-le-feu a été signé en septembre 1987, consacrant la victoire d'Habré. Les relations diplomatiques furent rétablies en octobre 1988.
Idryss Déby Itno le renversa le 1er Décembre 1990. Habré trouva refuge au Sénègal. Hissène Habré est soupçonné d'être responsable de la mort de milliers de personnes, le nombre exact étant inconnu.Des poursuites contre lui sont engagées en Belgique en application de la loi de compétences universelles qui, bien qu'abrogée en 2003, s'applique dans ce cas précis (certains plaignants ayant acquis la nationalité belge). Un mandat d'arrêt international, assorti d'une demande d'arrestation immédiate, est délivré par la justice belge le 19 Septembre 2005 et transmis aux autorités sénégalaises. Après son arrestation le 15 Novembre et une garde à vue de quelques jours, Hissène Habré est relâché, la justice sénégalaise s'étant finalement déclarée incompétente et l'affaire portée au niveau de l'Union Africaine.